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    • 肺腺癌ceRNA調控網絡構建及AFAP1-AS1功能驗證

      目的基于生物信息學方法構建肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特異性長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)相關的競爭性內源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)調控網絡,并分析肌動蛋白纖維相關蛋白1-反義RNA1(actinfilament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1)在LUAD中的功能機制,以期為LUAD治療靶點研究提供新的方向。方法從基因表達綜合性基因庫(GEO)中下載LUAD的基因芯片,并使用GEO2R在線軟件篩選LUAD與正常組織之間具有差異表達的lncRNA和mRNA,并通過在線數據庫預測其靶基因,構建ceRNA網絡,并進行富集分析。在細胞實驗中,對AFAP1-AS1進行基因敲除并構建siRNA,通過細胞轉染法轉染LUAD細胞A549。用CCK8、Transwell、劃痕實驗和流式細胞術實驗檢測細胞增殖、侵襲、遷移和凋亡的能力。結果在LUAD的芯片中共鑒定出6個差異表達lncRNA 和494個差異表達的mRNA。ceRNA 網絡共涉及6個lncRNA、22個miRNA和55個mRNA。富集分析發現mRNA與癌癥相關通路有關。在細胞實驗中,敲除AFAP1-AS1可抑制細胞增殖、侵襲和遷移,且AFAP1-AS1促進細胞凋亡。結論本研究構建了一個lncRNA介導的ceRNA網絡,這可能有助于進一步研究LUAD的作用機制。此外,通過細胞實驗,本研究發現AFAP1-AS1有潛力作為LUAD的治療靶點。

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